監理工程師初始注冊需要申請人在網上申請，然后提交相關證明材料，省建設主管部門進行初審，國務院建設主管部門進行復審。

監理工程師證書注冊流程：

1、申請人進入中國工程建設信息網或中華人民共和國建設部網站，登錄"注冊監理工程師管理系統"，填寫并打印《申請注冊監理工程師初始注冊申請表》。在網上申請注冊后，需將申請初始注冊的申報材料遞交申請人所在的聘用單位。

2、申請人所在的聘用單位在初始注冊申請表上簽署意見并加蓋單位印章后，將申請人初始注冊的申報材料【確認已上報】遞送到省建設主管部門進行初審。

3、省建設主管部門審查完畢后，將申請材料和初審意見報國務院建設主管部門，等待申請結果通知。